薛宇

时间：2009-12-29 浏览次数：

薛宇
职称职务	三级教授、博士生导师、华中学者特聘岗
学科专业	生物信息学、系统生物学
联系方式	联系电话：027-87793903 传真：027-87793172
电子邮箱	xueyu@hust.edu.cn


教育经历	1998/09 – 2002/07，中国科学技术大学，高分子科学与工程系，学士 2000/09 – 2002/07，中国科学技术大学，计算机科学与技术系，双学士 2002/09 – 2006/12，中国科学技术大学，生命科学学院，博士
工作经历	2007/01 – 2007/07，中国科学技术大学，生命科学学院，研究助理 2007/07 – 2009/07，中国科学技术大学，生命科学学院系统生物学系，副教授 2009/07 – 至今，华中科技大学，生命科学与技术学院生物医学工程系，教授
学术兼职	2013年6月应邀担任国际期刊PLOS ONE的Academic Editor 2013年11月任国际期刊BMC Genomics的Associate Editor
研究方向	本研究组的主要研究方向有：(1) 蛋白质共价修饰的计算生物学与系统生物学；(2) 基于修饰组大数据的生物信息学分析与可视化；(3) 共价修饰介导的蛋白质调控网络；(4) 基于修饰调控网络的潜在疾病、癌症的分子标记发现；(5) 修饰尤其是“新修饰”的资源整合与底物预测；(6) 共价修饰之间的相互影响 (crosstalk)。

近年的科研项目、专著与论文、专利、获奖

主持及参与多项国家自然科学基金、中科院和科技部973、重大研究计划等项目；发表SCI期刊论文40多篇，其中IF>7的论文13篇，包括Nature Protocols (IF=7.96) 1篇, Nucleic Acids Research (IF=8.278) 8篇，Molecular & Cellular Proteomics (IF= 7.251) 3篇和Cell Research (IF=10.526) 1篇，被他人引用~1000次，单篇最高引用>150次，H因子17；获专利1项，软件著作权4项；2006年获香港"求是"研究生奖学金；2008年入选"中国科学院优秀博士论文"；2010年入选教育部"新世纪优秀人才支持计划"；2012年、2013年率队分获"国际遗传工程的机器设计竞赛"(iGEM) 铜奖和银奖；2013年1月获"青年科学之星铜奖"。

近五年代表性论文

1. Liu Z, Wang Y, Gao T, Pan Z, Cheng H, Yang Q, Cheng Z, Guo A, Ren J, Xue Y**. (2014) CPLM: a database of protein lysine modifications. Nucleic Acids Research. 42(1): D531-6.
2. Wang Y, Liu Z, Cheng H, Gao T, Pan Z, Yang Q, Guo A, Xue Y**. (2014) EKPD: a hierarchical database of eukaryotic protein kinases and protein phosphatases. Nucleic Acids Research. 42(1):D496-502.
3. Gao T, Liu Z, Wang Y, Cheng H, Yang Q, Guo A, Ren J, Xue Y**. (2013) UUCD: a family-based database of ubiquitin and ubiquitin-like conjugation. Nucleic Acids Research. 41(D1):D445-51.
4. Liu Z, Ren J, Cao J, He J, Yao X, Jin C#, Xue Y#. (2013) Systematic analysis of the Plk-mediated phosphoregulation in eukaryotes. Briefings in Bioinformatics. 14(3):344-60.
5. Song C, Ye M, Liu Z, Cheng H, Jiang X, Han G, Songyang Z, Tan Y, Wang H, Ren J#, Xue Y#, Zou H#. (2012) Systematic analysis of protein phosphorylation networks from phosphoproteomic data. Molecular & Cellular Proteomics. 11(10):1070-83.
6. Liu Z, Cao J, Gao X, Zhou Y, Wen L, Yang X, Yao X, Ren J#, Xue Y#. (2011) CPLA 1.0: an integrated database of protein lysine acetylation. Nucleic Acids Research. 39:D1029-34.
7. Ren J, Jiang C, Gao X, Liu Z, Yuan Z, Jin C, Wen L, Zhang Z#, Xue Y#, Yao X#. (2010) PhosSNP for systematic analysis of genetic polymorphisms that influence protein phosphorylation. Molecular & Cellular Proteomics, 9:623-34.
8. Ren J, Liu Z, Gao X, Jin C, Ye M, Zou H, Wen L, Zhang Z, Xue Y#, Yao X#. (2010) MiCroKit 3.0: an integrated database of midbody, centrosome and kinetochore. Nucleic Acids Research, 38:D155-160.
9. Xue Y*, Ren J*, Gao X, Jin C, Wen L, Yao X. (2008) GPS 2.0, a tool to predict kinase-specific phosphorylation sites in hierarchy. Molecular & Cellular Proteomics. 7(9):1598-608.
10. Zhou F*, Xue Y*, Yao X, Xu Y. (2006) A general user interface for prediction servers of proteins' post-translational modification sites. Nature Protocols, 1(3), 1318-1321.
(**通讯作者，#共同通讯作者，*共同第一作者)

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