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教授简介

宁康
时间:2016-01-15      

宁康
职称职务 教授,博士生导师,楚天学者特聘教授
学科专业 生物信息学,系统生物学,微生物学
联系方式 027-87793041(电话)(传真)
电子邮箱 ningkang@hust.edu.cn
 
教育经历 1998年09月-2003年07月 中国科学技术大学计算机系,学士
2003年08月-2008年08月 新加坡国立大学计算机学院生物信息专业,博士
工作经历 2007年11月-2010年06月 美国密歇根大学,博士后
2010年08月-2015年03月 中国科学院青岛生物能源与过程研究所,副研究员/研究员
2015年04月-至今 华中科技大学生命科学与技术学院,教授
学术兼职 中国生物工程学会-计算生物学与生物信息学专业委员会委员;
中国遗传学会-生物大数据专业委员会委员;
中国细胞生物学学会-功能基因组信息学与系统生物学分会-转化医学信息学学组专家委员;
中国蛋白质组青年学者委员会委员;
担任Scientific Reports、Journal of Glycobiology、Journal of Computational Systems Biology等期刊编委;
担任英国自然环境研究委员会(UK-NERC)和英国生物技术与生物科学研究理事会(UK-BBSRC)等基金评委。
研究方向 研究方向为生物信息学、生物大数据挖掘、以及相关方法在微生物组学研究中的应用。研究重点包括:(1)创新性的微生物组学实验和数据分析,(2)微生物组学数据库系统的开发,(3)基于微生物组学大数据的群落宏基因组信息挖掘,(4)单细胞数据分析方法开发和应用,(5)蛋白组和调控网络等数据分析,(6)大数据分析算法和高性能计算等。

近年的科研项目、专著与论文、专利、获奖
作为负责人承担多项国家级科研项目,包括国家科技部十二五863课题,863子课题,国家自然科学基金委面上项目和青年项目、国家自然科学基金委中德中心合作项目等。已在Bioinformatics、Plant Cell、PloS Genetics、Journal of Proteome Research、Scientific Reports等高水平学术期刊发表学术论文50余篇,被引超过1000次。获得软件著作权6项(同时正在受理2项),获得发明专利受理5项。2015年率队获"国际遗传工程的机器设计竞赛"(iGEM) 金奖。
近五年代表性论文
1.Zhou Qian, Xiaoquan Su, and Kang Ning*. Assessment of quality control approaches for metagenomic data analysis. Scientific Reports 2014. 4:6957.
2.Xiaoquan Su, Jianqiang Hu, Shi Huang, and Kang Ning*. Rapid comparison and correlation analysis among massive number of microbial community samples based on MDV data model. Scientific Reports 2014. 4:6393.
3.Cheng Xinwei, Xiaoquan Su, Xiaohua Chen, Huanxin Zhao, Cunpei Bo, Jian Xu, Hong Bai*, Kang Ning*. Biological ingredient analysis of traditional Chinese medicine preparation based on high-throughput sequencing: the story for Liuwei Dihuang Wan. Scientific Reports 2014. 4:5147.
4.Xiaoquan Su, Xuetao Wang, Gongchao Jing, Kang Ning*. GPU-Meta-Storms: Computing the structure similarities among massive amount of microbial community samples using GPU. Bioinformatics 2014. 30 (7): 1031-1033.
5.Jianqiang Hu, Dongmei Wang, Jing Li, Kang Ning*, Jian Xu*.Genome-wide identification of transcription factors and transcription-factor binding sites in oleaginous microalgae Nannochloropsis, Scientific Reports 2014, 4:5454.
6.Jing Li#, Danxiang Han#, Dongmei Wang#, Kang Ning#, Jia Jing, Wei Li, Jing Xiaoyan, Huang Shi, Chen Jie, Li Yantao, Qiang Hu, Jian Xu. Choreography of transcriptomes and lipidomes of Nannochloropsis reveals the mechanisms of oleaginousness in microalgae, Plant Cell 2014, 26 (4), 1645-1665.
7.Dongmei Wang#, Kang Ning#, Jing Li#, Jianqiang Hu, Danxiang Han, Hui Wang, Xiaowei Zeng, Xiaoyan Jing, Qian Zhou, Xiaoquan Su, Xingzhi Chang, Anhui Wang, Wei Wang, Jing Jia, Li Wei, Yi Xin, Yinghe Qiao, Ranran Huang, Jie Chen, Bo Han, Russell T. Hill, Yonathan Zohar, Feng Chen, Qiang Hu, and Jian Xu. Nannochloropsis Genomes Reveal Evolution of Microalgal Oleaginous Traits. PLoS Genetics 2014, 10(1):e1004094.
8.Xiaoquan Su; Jian Xu; Kang Ning*. Meta-Storms: Efficient Search for Similar Microbial Communities Based on a Novel Indexing Scheme and Similarity Score for Metagenomic Data. Bioinformatics 2012. 28(19):2493-501.
9.Kang Ning, Damian Fermin, and Alexey I. Nesvizhskii. Comparative analysis of different label-free mass spectrometry based protein abundance estimates and their correlation with RNA-Seq gene expression data. Journal of Proteome Research 2012. 11(4):2261-71.
(#: co-first author, *: corresponding author )