华中科技大学生命科学与技术学院

2019新加坡国立大学计算生物学暑期交换项目

Day11&12 ：圣淘沙之旅&知识殿堂的造访

  7月15日，星期一，不出意外的又是一天的学习，但今早的床似乎格外的粘人，我们挣扎着才按时起床到达了教室，因为周日我们去了新加坡的最大岛屿——圣淘沙。

图1.抵达圣淘沙岛

 圣淘沙被誉为新加坡最迷人的度假小岛，因为只有一天，所以我们选择去了岛上富有盛名的环球影城，这是东南亚首个且唯一的环球影城主题公园。进入公园，我们顺着地图的路线，走过了繁华的纽约街区，跟着擎天柱一起保卫火种源；穿过了诡秘的金字塔，在侏罗纪公园漂流又跟着怪物史瑞克拯救了他的公主。整个公园有7大主题，我们花了一天的时间才体验完了这七片区域，不过其实这里并不算大，每一个区域都挨的很近，但每个区域又都各有特色并且很有意思。

  经过一天体验，我觉得环球影城就很好的体现了新加坡的一个特点：文化多元，小而精致。走在新加坡的路上，你可以看到形形色色的人，亚洲特征的、欧美洲特征的、非洲特征的，路边的标示也大都是英语+中文，人们说的语言更是多种多样，毕竟新加坡的官方语言就有4种。文化多元化在这里体现的淋漓尽致，更让人难以相信的是新加坡是个只有719.1平方公里的岛国，一个北京的面积就顶23个新加坡，面积虽小，新加坡却是一个高度发达且稳定的国家，这与她促进种族和谐的核心政策是分不开的。有了这样的体会，让我们这一天的收获又丰富了一些。

  但玩归玩，学还是要认真学的，课程已过半，但现在是最困难的阶段，因为我们既需要搞懂前面没听懂的知识，也需要学习课堂上新教授的知识。不得不说，课程是真的不简单。黄任祥老师的课侧重科学统计学的理论，今天主要学习了几种normalization的方法，即标准化，包括Preprocessing w/mean scaling、Z-score、 quantile normalization等等，主要介绍了quantile normalization应用中存在的问题，需要把病人和健康人样本分开标准化。

  宋永健老师的课侧重计算生物学的专业算法，今天下午主要学习了如何寻找SNV（Single Nucleotide Polymorphism），SNV是单核苷酸的一种替换，平均每1000bp就会出现一次，几率很高，且与很多疾病相关，寻找SNV的方法包括Counting alleles、Binomial distribution、Fisher exact test等等。

  结束了今天的学习，我们已经是累上加累，但我们却觉得很充实，收获满满的两天！

图2.宋永健老师在给我们讲如何寻找SNV