题目：工业微生物代谢工程与系统生物技术

报告人：李寅 研究员（中国科学院微生物研究所）

时间： 5 月 23 日 （星期五）上午9：00

地点：东十一楼(生命科学与技术学院)7楼会议室

报告人简介：

中国科学院微生物研究所研究员（博导），中国科学院微生物研究所能源与工业生物技术中心主任；中国科学院青岛生物能源与过程研究所(筹)学术委员会副主任，《生物工程学报》副主编，中国科技大学兼职博士生导师。

    李寅研究员先后主持和承担了“ 973 ” 、“ 863 ” 和国家自然科学基金项目多项，先后获得了多项奖励：2006年国家科技进步二等奖、2004年教育部提名国家科技进步二等奖、2003年中国石油与化学工业技术发明一等奖、2003年江苏省科技进步二等奖、2000年无锡市十大杰出青年等

研究方向为工业微生物分子生理学和系统生物技术，主要研究内容包括：

1、分子生理学和代谢工程。以乳酸菌及嗜酸、嗜碱、耐溶剂微生物为模型，利用基因组学和功能基因组学技术进行分子生理学研究，理解这些微生物过量合成大宗化学品的分子基础和调控机制，并在此基础上设计新的代谢工程策略，对微生物进行系统生物技术改造，实现大宗化学品的经济、绿色生产。

2、支撑系统生物技术的方法学。发展重要生物基化学品产生菌的高通量筛选方法，新型原核微生物遗传操作系统和基因组规模突变技术，不同水平(DNA、RNA、蛋白质、代谢物、代谢通量)组学数据的整合方法学，以及基因组规模代谢模型的构建及生物学功能预测方法。

主要论文包括：

Lactic Acid Bacteria: Genomics, genetics, physiology, and application

1.     Ryan KA, Daly P, Li Y, Hooton C, O’Toole PW. Strain-specific inhibition of Helicobacter pylori by Lactobacillus salivarius and other lactobacilli. J. Antimicrobial. Chemotherapy, 2008.

2.     Li Y, Canchaya C, Fang F, Raftis E, Ryan KA, van Pijkeren J-P, van Sinderen D, O’Toole PW. Distribution of megaplasmids in Lactobacillus salivarius and other lactobacilli. J. Bacteriol. 2007, 189(17): 6128-6139.

3.     Zhang J, Fu R-Y, Hugenholtz J, Li Y* Chen J*. Glutathione protects Lactococcus lactis against acid stress. Appl. Environ. Microbiol., 2007, 73(16): 5268-5275.

4.     Corr SC, Li Y, Riedel CU, O’Toole PW, Hill C, Gahan CGM. Bacteriocin production as a mechanism for the anti-infective activity of Lactobacillus salivarius UCC118. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2007, 104(18): 7617-7621. (cover article)

5.     Claesson MJ*, Li Y*, Leahy S, Canchaya C, van Pijkeren JP, Cerdeño-Tárragad AM, Parkhill J, Flynn S, Collins JK, Higgins D, Shanahan F, Fitzgerald GF, van Sinderen D, O'Toole PW. Multi-replicon genome architecture of Lactobacillus salivarius. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A., 2006, 103(17): 6718-6723. (cover article) (*equally contributed to this work).

6.     Li Y, Raftis E, Canchaya C, Fitzgerald GF, van Sinderen D, O'Toole PW. Polyphasic analysis indicates that Lactobacillus salivarius subsp. salivarius and Lactobacillus salivarius subsp. salicinius do not merit separate subspecies status. Int. J. Syst. Evol. Microbiol., 2006, 56(10): 2397-2403.

7.     van Pijkeren JP, Canchaya C, Ryan KA, Li Y, Claesson MJ, Sheil B, Steidler L, O’Mahony L, Fitzgerald GF, van Sinderen D, O’Toole PW. Comparative and functional analysis of sortase-dependent proteins in the predicted secretome of Lactobacillus salivarius. Appl. Environ. Microbiol., 2006, 72(6): 4143-4153.

8.     Ventura M, Canchaya C, Bernini V, Altermann E, Barrangou R, Mc Grath S, Claesson MJ, Li Y, Leahy S, Walker CD, Zink R, Neviani E, Steele J, Broadbent J, Klaenhammer TR, Fitzgerald GF, O’Toole PW, van Sinderen D. Comparative genomics and transcriptional analysis of prophages identified in the genomes of Lactobacillus gasseri, Lactobacillus salivarius and Lactobacillus casei. Appl. Environ. Microbiol., 2006, 72(5): 3130-3146.

9.     Fu R-Y, Bongers BS, van Swam II, Chen J, Molenaar D, Kleerebezem M, Hugenholtz J, Li Y*. Introducing glutathione biosynthetic capability into Lactococcus lactis subsp. cremoris NZ9000 improves the oxidative-stress resistance of the host. Metab. Eng. , 2006, 8(6): 662-671.

10.  Fu R-Y, Chen J, Li Y*. Heterologous production of transglutaminase in Lactococcus lactis significantly enhances the growth performance of the host. Appl. Environ. Microbiol., 2005, 71(12): 8911-8919.

11.  Li Y, Hugenholtz J, Sybesma W, Abee J, Molenaar D. Using Lactococcus lactis for glutathione overproduction. Appl. Microbiol. Biotechnol., 2005, 67(1): 83-90.

12.  Li Y, Hugenholtz J, Abee J, Molenaar D. Glutathione protects Lactococcus lactis against oxidative stress. Appl. Environ. Microbiol., 2003, 69(10): 5739-5745.

Industrial Biotechnology: efficient production of commodity and specialty chemicals

13.  Du C, Zhang Y, Li Y, Cao Z. A novel redox-potential-based screening strategy for rapid isolation of Klebsiella pneumoniae mutants with enhanced 1,3-propanediol producing capability. Appl. Environ. Microbiol., 2007, 73(14): 4515-4521

14.  Liu L-M, Li Y, Zhu Y, Du G, Chen J. Redistribution of carbon flux in Torulopsis glabrata by altering vitamin and calcium level. Metab. Eng. , 2007, 9(1): 21-29.

15.  Zhang Y, Li Y, Du C, Liu M, Cao Z. Inactivation of aldehyde dehydrogenase: a key factor for engineering 1,3-propanediol production by Klebsiella pneumoniae. Metab. Eng. , 2006, 8(6): 578-586.

16.  Liu L-M, Li Y, Chen J. Redirection of the NADH oxidation pathway in Torulopsis glabrata leads to an enhanced pyruvate production. Appl. Microbiol. Biotechnol., 2006, 72(2): 377-385.

17.  Du C, Yan H, Zhang Y, Li Y, Cao Z. Use oxidoreduction potential as an indicator to regulate 1,3- propanediol fermentation by Klebsiella pneumoniae. Appl. Microbiol. Biotechnol., 2006, 69(5): 554-563.

18.  Li Y, Wei G, Chen J. Glutathione: a review on biotechnological production. Appl. Microbiol. Biotechnol., 2004, 66(3): 233-242 (Mini-review)